Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Znf428Q8C1M2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Znf428Q8C1M2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms