Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccser1Q8C0C4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccser1Q8C0C4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms