Protein–RNA interactions for Protein: Q8C079

Strip1, Striatin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strip1Q8C079 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Strip1Q8C079 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Strip1Q8C079 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms