Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pggt1bQ8BUY9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Pggt1bQ8BUY9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pggt1bQ8BUY9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms