Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp54Q8BL06 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp54Q8BL06 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp54Q8BL06 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms