Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zcchc4Q8BKW4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zcchc4Q8BKW4 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms