Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tmem87bQ8BKU8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tmem87bQ8BKU8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms