Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tspan12Q8BKT6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tspan12Q8BKT6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms