Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKD6

Rnf144b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144B, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144bQ8BKD6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rnf144bQ8BKD6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf144bQ8BKD6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf144bQ8BKD6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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