Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tm2d3Q8BJ83 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tm2d3Q8BJ83 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms