Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX2

Timm29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm29Q8BGX2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm29Q8BGX2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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Timm29Q8BGX2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Timm29Q8BGX2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms