Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
U2af1l4Q8BGJ9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
U2af1l4Q8BGJ9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms