Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG54

Sptlc3, Serine palmitoyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptlc3Q8BG54 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sptlc3Q8BG54 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sptlc3Q8BG54 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sptlc3Q8BG54 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms