Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sv2bQ8BG39 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sv2bQ8BG39 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms