Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG21

Cacfd1, Calcium channel flower homolog, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacfd1Q8BG21 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cacfd1Q8BG21 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cacfd1Q8BG21 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms