Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
H2-M10.3Q85ZW6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-M10.3Q85ZW6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms