Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Srgap3Q812A2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Srgap3Q812A2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Srgap3Q812A2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms