Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

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Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Atg4cQ811C2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atg4cQ811C2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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Atg4cQ811C2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg4cQ811C2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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