Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmem39bQ810L4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmem39bQ810L4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms