Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg2bQ80XK6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atg2bQ80XK6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms