Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SnupnQ80W37 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SnupnQ80W37 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms