Protein–RNA interactions for Protein: Q80U95

Ube3c, Ubiquitin-protein ligase E3C, mousemouse

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3cQ80U95 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ube3cQ80U95 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ube3cQ80U95 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ube3cQ80U95 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms