Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RubcnQ80U62 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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RubcnQ80U62 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RubcnQ80U62 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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RubcnQ80U62 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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RubcnQ80U62 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RubcnQ80U62 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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RubcnQ80U62 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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RubcnQ80U62 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RubcnQ80U62 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms