Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Avl9Q80U56 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Avl9Q80U56 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms