Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC39.53■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC39.53■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
NischQ80TM9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC39.5■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.49■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC39.45■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
NischQ80TM9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC39.44■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.43■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
NischQ80TM9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
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