Protein–RNA interactions for Protein: Q80T74

Klhl29, Kelch-like protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl29Q80T74 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Klhl29Q80T74 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Klhl29Q80T74 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms