Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ClmQ7TSN2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ClmQ7TSN2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms