Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSI3

Ppp6r1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp6r1Q7TSI3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ppp6r1Q7TSI3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp6r1Q7TSI3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp6r1Q7TSI3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms