Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Kcnf1Q7TSH7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kcnf1Q7TSH7 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms