Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH3

Znf516, Zinc finger protein 516, mousemouse

Predictions only

Length 1,157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf516Q7TSH3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf516Q7TSH3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Olfr128-201ENSMUST00000080231 1050 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm17555-201ENSMUST00000164042 1113 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Znf516Q7TSH3 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms