Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smap2Q7TN29 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smap2Q7TN29 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms