Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sys1Q78S06 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sys1Q78S06 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms