Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Msrb2Q78J03 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msrb2Q78J03 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms