Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Rph3alQ768S4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rph3alQ768S4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Rph3alQ768S4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rph3alQ768S4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rph3alQ768S4 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Rph3alQ768S4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rph3alQ768S4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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