Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Sned1Q70E20 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Sned1Q70E20 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sned1Q70E20 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms