Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rpl35Q6ZWV7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms