Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Chsy1Q6ZQ11 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Chsy1Q6ZQ11 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Chsy1Q6ZQ11 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms