Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc44a1Q6X893 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc44a1Q6X893 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms