Protein–RNA interactions for Protein: Q6X1Y6

Asic3, Acid-sensing ion channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic3Q6X1Y6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Asic3Q6X1Y6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Asic3Q6X1Y6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms