Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cxcl3Q6W5C0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cxcl3Q6W5C0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms