Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc88cQ6VGS5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms