Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Slc9c1Q6UJY2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9c1Q6UJY2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9c1Q6UJY2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9c1Q6UJY2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc9c1Q6UJY2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms