Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Scgb2b2Q6UGQ3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scgb2b2Q6UGQ3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms