Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GcsamQ6RFH4 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms