Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc57Q6PHN1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ccdc57Q6PHN1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms