Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Scaf4Q6PFF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Scaf4Q6PFF0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms