Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Taf1cQ6PDZ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Taf1cQ6PDZ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms