Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vstm2lQ6PDS0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Vstm2lQ6PDS0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms