Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zbtb39Q6PDK0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Zbtb39Q6PDK0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Zbtb39Q6PDK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms