Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI6

Mindy2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-2, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy2Q6PDI6 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mindy2Q6PDI6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mindy2Q6PDI6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms